艾柏森生物有專業(yè)生物信息團隊，可以通過三維建模的方式對抗原、抗體以及抗原/抗體復(fù)合物進行結(jié)構(gòu)生物學(xué)的分析。同時結(jié)合其他生物信息學(xué)分析方法，提供抗原表位預(yù)測的服務(wù)。

相關(guān)服務(wù):

★X-射線晶體學(xué)

★通過肽庫方法

★通過LC-MS法

★通過三維電鏡方法

★基于生物信息學(xué)預(yù)測.

技術(shù)平臺:

★抗體定制服務(wù)平臺

近年來,發(fā)現(xiàn)一類新的長約21-25nt的非編碼內(nèi)源性小分子RNA--microRNA(簡稱miRNA).miRNA的一個特點是它的前體形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),成熟體在莖環(huán)結(jié)構(gòu)的一側(cè)上,成熟體序列內(nèi)不能包含大的內(nèi)環(huán)和突環(huán),特別是不能包含大的不對稱環(huán).miRNA通過與靶基因mRNA的特定位點互補配對達到對靶基因的降解或翻譯抑制,從而參與基因的表達調(diào)控.miRNA通常位于基因間隔區(qū)(intergenic region),也有一部分來源于編碼區(qū)的內(nèi)含子.一些miRNA的基因結(jié)構(gòu)和功能在進化中呈現(xiàn)高度的保守性,但是病毒miRNA和其他一些真核生物的miRNA并不具有這種特點. 由于miRNA對生命體具有非常重要的調(diào)控功能,而且近年來發(fā)現(xiàn),miRNA與人類疾病的發(fā)生有著密切的聯(lián)系,因此尋找新的miRNA是生命科學(xué)領(lǐng)域的一大熱點.04年以來,病毒miRNA又成為研究的重點.尋找miRNA基因的方法有實驗方法和生物信息學(xué)方法,兩種方法結(jié)合使用,才能準確地找到miRNA基因.到目前為止,miRBase上公布的miRNA已有5395種,其中病毒的miRNA有130種.然而不同生物中的仍有大量的miRNA基因尚待鑒定,生物信息學(xué)分析手段為發(fā)現(xiàn)新的miRNA基因提供了有效的方法.從2003年出現(xiàn)第一個miRNA的預(yù)測工具MiRscan后,出現(xiàn)了很多計算預(yù)測miRNA的方法,根據(jù)其本質(zhì)可以分為五類:同源片段搜索方法,基于比較基因組學(xué)的預(yù)測方法,基于序列和結(jié)構(gòu)特征打分的預(yù)測方法,結(jié)合作用靶標的預(yù)測方法和機器學(xué)習(xí)方法. 由于不同病毒的miRNA之間序列相似性極低,不同物種miRNA的特點又不盡相同,針對這一問題,我們開發(fā)了一個預(yù)測與探尋miRNA基因的計算機軟件MiRfilter.MiRfilter是由C#語言編碼,文章詳細地介紹了它的設(shè)計流程,重點講述了實現(xiàn)預(yù)測的三個重要算法:發(fā)夾結(jié)構(gòu)判斷算法,篩選成熟體算法和CDS字段搜索算法.并詳盡地講解了它的使用方法.我們用兩種病毒的miRNA檢測軟件的精度,結(jié)果標明MiRfilter精度較高,假陽性控制較好.